在正常运行一段时间后，反渗透膜元件会受到给水中可能存在的悬浮物或难溶盐的污染。比较常见的反渗透膜污染物有碳酸钙沉淀、硫酸钙沉淀、金属氧化物沉淀、无机或有机沉积混合物、合成有机物、硅沉积物、微生物等污染。不同的污染物，清洗方法也就不同。

1、碳酸钙垢

碳酸钙垢是一种矿物结垢。当阻垢剂/分散剂添加系统出现故障时，或是加酸PH调节系统出现故障引起给水PH增高时，碳酸钙垢有可能沉积出来。尽早检测碳酸钙垢，可以防止膜层表面沉积的晶体损伤膜元件。早期检测出碳酸钙垢，可以通过降低给水的PH值至3-5，运行1-2小时来去除。对于长时间沉寂的碳酸钙垢，可用低PH值的柠檬酸溶液清洗去除。

2、硫酸钙、硫酸钡、硫酸锶垢

硫酸盐垢是比碳酸钙垢硬很多的矿物质垢，且不易去除。硫酸盐垢可在阻垢剂/分散剂添加系统出现故障或加硫酸调节PH时沉积出来。硫酸钡和硫酸锶垢较难去除。因为它们几乎在所有的清洗溶液中难以溶解。因此，应加以特别注意以防止此类结垢的形成。

3、金属氧化物/氢氧化物污染

典型的金属氧化物和金属氢氧化物污染为铁、锌、锰、铜、铝等。这种污垢的形成原因可能是装置管路、容器的腐蚀产物，或是空气中氧化的金属离子、氯、臭氧、钾、高锰酸盐，或是由在预处理过滤系统中使用铁或铝助凝剂所致。

4、聚合硅垢

硅凝胶层垢由溶解性硅的过饱和态及聚合物所致，非常难以去除，可以采用传统的化学清洗方法。如果传统的方法不能解决，可以与专门的技术公司联系。现有的化学清洗药剂，如氟化氢铵，已在一些项目上得到了成功的使用，但是在使用过程中必须考虑此方法的操作危害和对设备的损坏，做好必要的防护措施。

5、胶体污染

胶体是悬浮在水中的无机物或是有机或无极混合物的颗粒，是最常见的反渗透膜污染物之一。它不会由于自身重力而沉淀。胶体物通常含有多种组分，如：铁、铝、硅、硫、或有机物等。

6、非溶性的天然有机物污染

非溶性的天然有机物污染通常是由地表水或深井水中的营养物的分解而导致的。有机污染的化学机理很复杂，主要组分是腐殖酸或是灰黄霉酸。非溶性的天然有机物被吸附到膜表面，可造成RO膜元件的快速污染，一旦吸收作用产生，结成凝胶或块状的污染过程就会开始。

7、微生物沉积

有机沉积物是由细菌粘泥、真菌、霉菌等生成的，这种污染物较难去除，尤其是在给水通路被完全堵塞的情况下，给水通路堵塞会使清洁的进水难以充分均匀地进入反渗透膜元件内。为抑制这种沉积物的进一步生长，不仅要清洁和维护RO系统，同时还要清洁预处理、管道及端头等。

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